ta克隆怎么排除协同感染
Ⅰ TA克隆的具体原理及方法求教。~~~~~
ta克隆方法(original
ta
cloning
kit)把pcr片断与一个具有3-t突出的载体dna连接起来的方法。因为pcr反应中所适用的聚合酶具有末端转移的活性,通常在3加上a。例如:taq聚合酶同时具有的末端连接酶的功能,pcr反应时在每条pcr扩增产物的3端自动添加一个3-a突出端。只有用经过特殊处理的具有3-t突出末端的dna片断才能通过t/a配对进行连接。通过pcr的方法扩增目的基因片断的过程中,由于往往不清楚目的基因的dna序列,获得的目的片断通常需要通过ta克隆的方法,重组到t-载体中,通过序列测定清楚dna序列。由于在pcr过程中,使用的dna聚合酶不同,往往分为2种情况:(1)使用不同的taq酶,在pcr扩增循环结束后,加上72℃
10分钟一个过程,taq酶可以在扩增产物的3末端加上a,因此pcr产物回收纯化后可以和t载体直接连接。(2)使用高保真的dna聚合酶,如pfu酶,由于其不能在扩增产物的3末端加上a,得到的dna序列为钝端,因此,需要在回收纯化后进行加a的过程,通常是以pcr回收产物为模板,加上一定量的普通taq酶和反应液,加入datp(或dntp),
72℃
10分钟,然后将加a产物直接用于ta连接。
Ⅱ ta克隆的优缺点
一、缺点:
1、PCR产物的酶切和判断比较困难。
2、另外酶切连接过程本身也相当地费时费力。
二、优点:
1、克隆PCR产物较简便、快捷的方法。
2、不需使用含限制酶序列的引物,不需将 PCR 产物进行优化,不需把PCR产物做平端处理,不需在 PCR 扩增产物上加接头,即可直接进行克隆。
(2)ta克隆怎么排除协同感染扩展阅读:
T-A克隆由于在PCR过程中,使用的DNA聚合酶不同,往往分为2种情况:
1、使用高保真的DNA聚合酶,如pfu酶,由于其不能在扩增产物的3末端加上A,得到的DNA序列为钝端,因此,需要在回收纯化后进行加A的过程,通常是以PCR回收产物为模板,加上一定量的普通Taq酶和反应液,加入dATP(或dNTP), 72℃ 10分钟,然后将加A产物直接用于TA连接。
2、使用不同的Taq酶,在PCR扩增循环结束后,加上72℃ 10分钟一个过程,Taq酶可以在扩增产物的3末端加上A,因此PCR产物回收纯化后可以和T载体直接连接。